Bonjour,... manque quelques infos.
il ne fonctionnait pas AVANT le changement de moteur - puis - il ne fonctionne toujours pas DEPUIS le changement ? C'est ça.
Qu'est-ce que votre beau-frère a changé ? le moteur + ECU + injecteur + bougie + systeme d'air... ou seulement le moteur en remettant les anciens accessoires (ECU, injecte...)
Euh, c'est un Deux temps ou un quatre ?

- décalage du point d'allumage ou de celui d'injection ? sans doute contrôlés par un boitier ECU sur ce moteur...
Sans oublier que sur un moteur à injection (électronique) la charge de la batterie doit être PARFAITE (le fait que démarreur entraine le moulin n'est pas un indice suffisant...). l'ECU ne fonctionnera correctement qu'au dessus de 12,8v.

(- Si ce 50 est un deux temps, vérifier l'état des valves (laminar))

Sans faire le donneur de conseils (pas le payeur donc) hop un petit tour garagiste, n'arrangerait-il pas tout simplement la situation - Non ? Quelque chose me dit que chez peugeot il existe un petit boitier GameBoy (boitier diagnostique) qui permet de checker les anomalies et réglages du scooter.