Hello Vounet,
Une piste, peut-être complètement hors sujet: et si l'injection ne recevait pas en continu l'alimentation électrique, ce qui provoquerait des micro coupures? par exemple dû à des cosses mal serrées à la batterie, un fil électrique qui se balade, voire une batterie un peu faiblarde?
J'essaie d'aider avec mes maigres connaissances mécaniques, ton problème n'a peut-être rien à voir avec une cause électrique mais je me suis récemment rendu compte à mes dépens que sur les scooters modernes mieux vaut avoir une circulation fluide du jus qui sort de la batterie!
Tiens nous au courant ;-)
PS: j'imagine que tu as vérifié que la batterie est OK